比如把自己制作好的bam文件的坐标,跟提取自gtf文件的坐标信息对应起来,使用GenomicRanges包自带的函数即可。ann1 <- data.frame( GeneID=c("gene...
写在前面你现在看到的是文献俱乐部2019年笔记分享第一弹,我将会在春节7天连续分享,目录如下:2019年1月份第1周(总第49周)单细胞转录组探索CAFs的功能和空间异质性2019年1月份第2周(总第50周)异常CRC病人的突变时空异质性与...
使用BIOCONDUCTOR注释包如果该芯片平台有对应的bioconductor注释包,只有约90个常用的芯片有!比如:library(hgu133a.db) ids=toTable(hgu133aSYMBOL) head(ids)##...
不同物种的同一个基因的对应关系我们都知道不同的物种在进化过程中其实共享很多基因的,尤其是哺乳动物,同一个基因虽然在不同的物种序列不完全一样,位于的染色体也不一样,发挥的功能可能也稍微有点区别,但是他们的相似性非常高!根据相似性就可以在不同的...
VMware workstation 中的win7虚拟机在一段时间不用后就会自动挂起。其实这不是VMware workstation 的问题,而是win7的问题。关闭win7系统 的自动休眠功能即可。具体操作:控制面板 → 硬件和...
R version 3.1.3 (2015-03-09) -- "Smooth Sidewalk"Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing...
一、R简介1.R与Matlab R更专业,偏向统计功能的实现,R开源且跨平台 Matlab则更通用,可以面对更多的数学情景,且收费 (参考:https://zhidao.baidu.com/question/3...
> install.packages("ggplot2")Installing package into ‘C:/Users/*/Documents/R/win-library/3.2’(as ‘lib’ is u...
做WGCNA时候,加载WGCNA时,提示Error in library(WGCNA) : 不存在叫‘WGCNA’这个名字的程辑包具体如图解决思路选择程序包——安装程序包自动安装依赖包...
WGCNA 分析基本概念WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式,推荐5组(或者15个样品)以上的数据...