生物技术
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GEO多数据集联合，傻瓜式一站式分析～零代码也能搞定！
GEOexplorer数据库基于GEO数据库的基因表达分析及可视化功能数据库嗨，小伙伴们大家好！你是否曾有因为没有GEO2R不会R而面对海量数据无从下手的尴尬？你是否曾因为不是肿瘤领域无可用数据库而郁郁寡欢？时常听到小小伙伴们叹气说“曾经有...
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multiqc 报错ImportError: No module named multiqc.__main__
(base) ***@***-pc:/public/sra$ multiqc --helpTraceback (most recent call last): File "/home/***/.local/bin/mu...
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fastq-dump安装及使用
fastq-dump是sratoolkit软件中的一个功能，首先安装sratoolkit1：安装Linux：curl -O https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/srat...
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RNA-seq，生信技能树
sra文件地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/下载测序数据# 循环下载sra文件1，for ((i=677;i<=680;i+...
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编译安装samtools
编译安装samtools相关文件下载编译samtools添加环境变量其他相关文件下载samtoolshtslib (如果samtools文件夹有，则不需要)编译samtools./configure make一般会报错，提示b...
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busybox编译 fatal error: curses.h: 没有那个文件或目录解决办法
busybox编译 fatal error: curses.h: 没有那个文件或目录解决办法执行make menuconfig时出现如下错误@ubuntu:/home/dev/busybox-1.19.3# make menuconfigH...
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NCBI数据库文件扩展名解析*.1
For more details, contact the NCBI help desk: info@ncbi.nlm.nih.gov ...
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NCBI上基因组文件格式及解释
最近在对于一些关于基因组的数据进行处理，发现如果在NCBI上下载一个物种例如E. coil的基因组序列之后，有很多并不常见的文件类型，例如.asn.faa.ffn.fna *.val 等等，处于好奇，特意去查了这些文件的意义是什么，总结如下...
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tophat2安装和问题的解决
在安装tophat2安装简单但会碰到的问题tophat2安装wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz解压tar -z...
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使用trim_galore对NGS数据进行质量过滤
欢迎关注”生信修炼手册”!cutadapt软件可以对NGS数据进行质量过滤，FastQC软件可以查看NGS数据的质量分布，trim_galore将这两个软件封装到一起，使用起来更加的方便。 官网如下https://www.bioinfor...