Windows 下R软件如何安装GO.db程序包

Windows 下R软件如何安装GO.db程序包

问题描述：

因为分析数据要用到WGCNA，然而安装WGCNA必须先安装GO.db。

但现在安装不了GO.db：

> library(WGCNA)

载入需要的程辑包：dynamicTreeCut

载入需要的程辑包：fastcluster

载入程辑包：‘fastcluster’

The following object is masked from ‘package:stats’:hclust

Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 

不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包

#然后我打算用bioconductor.org网站上的语句安装，但遇到以下问题：

> source("https://bioconductor.org/ biocLite.R") 

Error in file(filename, "r", encoding = encoding) : 无法打开链结

此外: Warning message:

In file(filename, "r", encoding = encoding) : InternetOpenUrl失败:’'

#另外，只能下载到GO.db_3.3.0.tar.gz，但是windows又是不支持tar压缩文件的

解决方案：

针对上述问题，主要是没有找到Go.db 的.zip文件，在下述网站下载（加载会有点慢）：

http://bioconductor.riken.jp/packages/3.0/data/annotation/html/GO.db.html

进入该网站

选择windows binary的zip文件下载

上述网站若加载不了，可google一下Go.db 3.0.0.zip

最后在R下进行安装该文件即可

选择windows binary的zip文件下载

然后进行在tools上选择install安装，并选择刚才下载的包的相应目录即可